Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GIMD1P0DJR0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GIMD1P0DJR0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms