Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SAA1P0DJI8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms