Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM13P0DJ93 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM13P0DJ93 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms