Protein–RNA interactions for Protein: P0CB47

UBTFL1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFL1P0CB47 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBTFL1P0CB47 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBTFL1P0CB47 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBTFL1P0CB47 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms