Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM228BP0C875 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM228BP0C875 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM228BP0C875 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.3 ms