Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPAP09012 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms