Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPRAP08240 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPRAP08240 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms