Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN1P07384 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN1P07384 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN1P07384 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms