Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT18P05783 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT18P05783 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT18P05783 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT18P05783 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT18P05783 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT18P05783 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT18P05783 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT18P05783 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT18P05783 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT18P05783 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT18P05783 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT18P05783 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT18P05783 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT18P05783 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT18P05783 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT18P05783 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT18P05783 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT18P05783 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT18P05783 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT18P05783 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT18P05783 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT18P05783 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT18P05783 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT18P05783 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT18P05783 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT18P05783 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT18P05783 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT18P05783 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT18P05783 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT18P05783 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT18P05783 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT18P05783 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT18P05783 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT18P05783 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT18P05783 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT18P05783 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT18P05783 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT18P05783 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT18P05783 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT18P05783 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT18P05783 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT18P05783 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT18P05783 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT18P05783 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT18P05783 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT18P05783 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT18P05783 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT18P05783 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT18P05783 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT18P05783 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT18P05783 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT18P05783 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT18P05783 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT18P05783 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT18P05783 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT18P05783 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT18P05783 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT18P05783 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT18P05783 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT18P05783 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT18P05783 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT18P05783 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT18P05783 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT18P05783 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT18P05783 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT18P05783 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT18P05783 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT18P05783 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT18P05783 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT18P05783 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT18P05783 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT18P05783 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT18P05783 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT18P05783 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT18P05783 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT18P05783 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT18P05783 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT18P05783 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT18P05783 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT18P05783 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT18P05783 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT18P05783 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT18P05783 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT18P05783 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT18P05783 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT18P05783 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT18P05783 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT18P05783 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT18P05783 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT18P05783 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT18P05783 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT18P05783 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT18P05783 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT18P05783 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT18P05783 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT18P05783 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT18P05783 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT18P05783 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT18P05783 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms