Protein–RNA interactions for Protein: P05166

PCCB, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCBP05166 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCCBP05166 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCCBP05166 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCCBP05166 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCCBP05166 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCCBP05166 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCCBP05166 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCCBP05166 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCCBP05166 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCCBP05166 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCCBP05166 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCCBP05166 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCCBP05166 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCCBP05166 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCCBP05166 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCCBP05166 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCCBP05166 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCCBP05166 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCCBP05166 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCCBP05166 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCCBP05166 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCCBP05166 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCCBP05166 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCCBP05166 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCCBP05166 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCCBP05166 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCCBP05166 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCCBP05166 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCCBP05166 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCCBP05166 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCCBP05166 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCCBP05166 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCCBP05166 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCCBP05166 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCCBP05166 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCCBP05166 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCCBP05166 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCCBP05166 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCCBP05166 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCCBP05166 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCCBP05166 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCCBP05166 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCCBP05166 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCCBP05166 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCCBP05166 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCCBP05166 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCCBP05166 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCCBP05166 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCCBP05166 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCCBP05166 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCBP05166 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCBP05166 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCBP05166 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCBP05166 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCBP05166 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCBP05166 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCCBP05166 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCBP05166 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCBP05166 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCBP05166 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCBP05166 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCBP05166 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCBP05166 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCBP05166 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCBP05166 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCCBP05166 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCBP05166 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCBP05166 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCBP05166 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCBP05166 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCBP05166 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCBP05166 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCBP05166 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCBP05166 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCBP05166 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCBP05166 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCBP05166 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCCBP05166 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCCBP05166 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCCBP05166 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCCBP05166 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCCBP05166 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCCBP05166 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCCBP05166 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCCBP05166 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCCBP05166 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms