Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBC1P01850 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBC1P01850 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRBC1P01850 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRBC1P01850 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRBC1P01850 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms