Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IGKV1-5P01602 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV1-5P01602 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms