Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POMCP01189 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POMCP01189 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POMCP01189 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POMCP01189 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POMCP01189 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMCP01189 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMCP01189 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMCP01189 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMCP01189 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMCP01189 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POMCP01189 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMCP01189 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMCP01189 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMCP01189 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMCP01189 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POMCP01189 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMCP01189 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POMCP01189 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POMCP01189 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POMCP01189 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POMCP01189 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POMCP01189 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POMCP01189 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POMCP01189 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POMCP01189 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POMCP01189 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POMCP01189 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POMCP01189 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POMCP01189 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POMCP01189 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POMCP01189 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POMCP01189 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POMCP01189 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POMCP01189 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POMCP01189 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POMCP01189 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMCP01189 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMCP01189 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMCP01189 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMCP01189 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMCP01189 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POMCP01189 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POMCP01189 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POMCP01189 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
POMCP01189 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMCP01189 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMCP01189 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POMCP01189 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POMCP01189 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POMCP01189 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POMCP01189 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POMCP01189 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POMCP01189 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POMCP01189 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POMCP01189 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POMCP01189 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POMCP01189 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POMCP01189 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POMCP01189 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POMCP01189 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POMCP01189 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POMCP01189 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POMCP01189 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POMCP01189 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POMCP01189 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POMCP01189 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POMCP01189 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMCP01189 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMCP01189 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMCP01189 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMCP01189 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMCP01189 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMCP01189 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMCP01189 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMCP01189 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMCP01189 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMCP01189 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMCP01189 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POMCP01189 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POMCP01189 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POMCP01189 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POMCP01189 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POMCP01189 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMCP01189 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMCP01189 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMCP01189 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMCP01189 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMCP01189 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMCP01189 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMCP01189 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POMCP01189 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMCP01189 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMCP01189 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMCP01189 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMCP01189 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMCP01189 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POMCP01189 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMCP01189 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMCP01189 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms