Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDHAP00338 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDHAP00338 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDHAP00338 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDHAP00338 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDHAP00338 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDHAP00338 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDHAP00338 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDHAP00338 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDHAP00338 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDHAP00338 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDHAP00338 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDHAP00338 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDHAP00338 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDHAP00338 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDHAP00338 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDHAP00338 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDHAP00338 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDHAP00338 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDHAP00338 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LDHAP00338 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDHAP00338 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LDHAP00338 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDHAP00338 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDHAP00338 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDHAP00338 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDHAP00338 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDHAP00338 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDHAP00338 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LDHAP00338 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDHAP00338 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDHAP00338 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDHAP00338 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDHAP00338 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDHAP00338 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDHAP00338 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDHAP00338 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDHAP00338 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDHAP00338 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDHAP00338 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHAP00338 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHAP00338 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHAP00338 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHAP00338 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHAP00338 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDHAP00338 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHAP00338 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHAP00338 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHAP00338 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHAP00338 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHAP00338 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHAP00338 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHAP00338 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHAP00338 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHAP00338 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDHAP00338 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHAP00338 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHAP00338 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHAP00338 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHAP00338 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHAP00338 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHAP00338 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHAP00338 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHAP00338 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDHAP00338 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHAP00338 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHAP00338 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHAP00338 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHAP00338 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHAP00338 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHAP00338 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHAP00338 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHAP00338 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHAP00338 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHAP00338 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDHAP00338 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHAP00338 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHAP00338 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHAP00338 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHAP00338 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHAP00338 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHAP00338 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHAP00338 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHAP00338 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHAP00338 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LDHAP00338 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms