Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PEX11BO96011 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms