Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC24AO95486 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24AO95486 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms