Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRATO95237 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRATO95237 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRATO95237 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRATO95237 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRATO95237 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRATO95237 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRATO95237 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRATO95237 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRATO95237 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRATO95237 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRATO95237 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRATO95237 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRATO95237 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRATO95237 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRATO95237 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRATO95237 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRATO95237 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRATO95237 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRATO95237 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRATO95237 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRATO95237 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRATO95237 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRATO95237 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRATO95237 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRATO95237 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRATO95237 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRATO95237 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRATO95237 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRATO95237 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRATO95237 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRATO95237 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRATO95237 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRATO95237 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRATO95237 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRATO95237 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRATO95237 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRATO95237 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRATO95237 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRATO95237 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRATO95237 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRATO95237 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRATO95237 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRATO95237 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRATO95237 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRATO95237 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRATO95237 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRATO95237 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRATO95237 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRATO95237 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRATO95237 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRATO95237 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRATO95237 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRATO95237 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRATO95237 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRATO95237 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRATO95237 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRATO95237 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRATO95237 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRATO95237 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRATO95237 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRATO95237 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRATO95237 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRATO95237 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRATO95237 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRATO95237 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRATO95237 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRATO95237 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRATO95237 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRATO95237 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRATO95237 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRATO95237 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRATO95237 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRATO95237 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRATO95237 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRATO95237 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRATO95237 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRATO95237 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRATO95237 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRATO95237 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRATO95237 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms