Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNUPNO95149 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNUPNO95149 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms