Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CAPN15O75808 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CAPN15O75808 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CAPN15O75808 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms