Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SAP30O75446 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAP30O75446 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAP30O75446 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SAP30O75446 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SAP30O75446 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAP30O75446 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAP30O75446 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAP30O75446 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SAP30O75446 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAP30O75446 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAP30O75446 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAP30O75446 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAP30O75446 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAP30O75446 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAP30O75446 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAP30O75446 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAP30O75446 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAP30O75446 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAP30O75446 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAP30O75446 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAP30O75446 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAP30O75446 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAP30O75446 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAP30O75446 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAP30O75446 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAP30O75446 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAP30O75446 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAP30O75446 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAP30O75446 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SAP30O75446 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAP30O75446 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAP30O75446 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAP30O75446 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAP30O75446 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAP30O75446 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SAP30O75446 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAP30O75446 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAP30O75446 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAP30O75446 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAP30O75446 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAP30O75446 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAP30O75446 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SAP30O75446 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAP30O75446 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAP30O75446 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SAP30O75446 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms