Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRCH4O75427 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRCH4O75427 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms