Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDC45O75419 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CDC45O75419 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC45O75419 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDC45O75419 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC45O75419 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDC45O75419 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDC45O75419 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDC45O75419 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDC45O75419 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDC45O75419 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CDC45O75419 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC45O75419 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC45O75419 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC45O75419 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC45O75419 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDC45O75419 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC45O75419 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC45O75419 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC45O75419 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC45O75419 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC45O75419 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC45O75419 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC45O75419 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC45O75419 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDC45O75419 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC45O75419 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC45O75419 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC45O75419 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC45O75419 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC45O75419 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC45O75419 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDC45O75419 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC45O75419 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC45O75419 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC45O75419 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC45O75419 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC45O75419 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC45O75419 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC45O75419 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC45O75419 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC45O75419 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDC45O75419 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC45O75419 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC45O75419 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC45O75419 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC45O75419 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC45O75419 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC45O75419 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC45O75419 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDC45O75419 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC45O75419 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC45O75419 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC45O75419 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDC45O75419 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDC45O75419 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CDC45O75419 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDC45O75419 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC45O75419 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC45O75419 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC45O75419 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC45O75419 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC45O75419 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC45O75419 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC45O75419 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC45O75419 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDC45O75419 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC45O75419 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC45O75419 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC45O75419 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC45O75419 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC45O75419 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC45O75419 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC45O75419 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC45O75419 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC45O75419 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDC45O75419 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC45O75419 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC45O75419 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC45O75419 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC45O75419 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC45O75419 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC45O75419 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC45O75419 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDC45O75419 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC45O75419 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC45O75419 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC45O75419 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDC45O75419 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC45O75419 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC45O75419 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC45O75419 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC45O75419 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC45O75419 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC45O75419 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC45O75419 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC45O75419 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC45O75419 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC45O75419 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC45O75419 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms