Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH16O75309 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH16O75309 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH16O75309 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH16O75309 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH16O75309 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH16O75309 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH16O75309 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH16O75309 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH16O75309 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH16O75309 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH16O75309 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH16O75309 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH16O75309 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH16O75309 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH16O75309 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH16O75309 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH16O75309 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH16O75309 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH16O75309 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH16O75309 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH16O75309 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH16O75309 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH16O75309 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH16O75309 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH16O75309 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH16O75309 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH16O75309 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH16O75309 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH16O75309 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH16O75309 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH16O75309 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH16O75309 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH16O75309 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH16O75309 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH16O75309 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH16O75309 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH16O75309 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH16O75309 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH16O75309 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH16O75309 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH16O75309 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH16O75309 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH16O75309 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH16O75309 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH16O75309 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH16O75309 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH16O75309 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH16O75309 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH16O75309 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH16O75309 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH16O75309 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH16O75309 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH16O75309 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH16O75309 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH16O75309 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH16O75309 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH16O75309 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH16O75309 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH16O75309 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH16O75309 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH16O75309 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH16O75309 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH16O75309 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH16O75309 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH16O75309 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH16O75309 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH16O75309 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH16O75309 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH16O75309 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH16O75309 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH16O75309 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH16O75309 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH16O75309 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH16O75309 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH16O75309 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH16O75309 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH16O75309 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH16O75309 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH16O75309 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH16O75309 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH16O75309 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH16O75309 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH16O75309 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH16O75309 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH16O75309 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms