Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR5O60602 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR5O60602 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR5O60602 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR5O60602 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR5O60602 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR5O60602 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR5O60602 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR5O60602 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR5O60602 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR5O60602 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR5O60602 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR5O60602 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR5O60602 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR5O60602 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR5O60602 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR5O60602 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR5O60602 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR5O60602 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR5O60602 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR5O60602 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR5O60602 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR5O60602 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR5O60602 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR5O60602 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR5O60602 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR5O60602 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR5O60602 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR5O60602 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR5O60602 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR5O60602 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR5O60602 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR5O60602 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR5O60602 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR5O60602 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR5O60602 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR5O60602 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR5O60602 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR5O60602 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR5O60602 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR5O60602 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR5O60602 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR5O60602 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR5O60602 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR5O60602 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR5O60602 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR5O60602 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR5O60602 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR5O60602 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR5O60602 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR5O60602 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR5O60602 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR5O60602 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR5O60602 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR5O60602 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR5O60602 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR5O60602 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR5O60602 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR5O60602 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR5O60602 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR5O60602 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR5O60602 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR5O60602 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR5O60602 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR5O60602 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR5O60602 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR5O60602 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR5O60602 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR5O60602 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR5O60602 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR5O60602 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR5O60602 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR5O60602 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR5O60602 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR5O60602 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR5O60602 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR5O60602 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR5O60602 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR5O60602 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR5O60602 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR5O60602 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TLR5O60602 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TLR5O60602 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR5O60602 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR5O60602 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms