Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GRIN3BO60391 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GRIN3BO60391 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms