Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCH6O60337 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH6O60337 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH6O60337 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms