Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRICKLE3O43900 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRICKLE3O43900 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRICKLE3O43900 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms