Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3O43889 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3O43889 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3O43889 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3O43889 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3O43889 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3O43889 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3O43889 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3O43889 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3O43889 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3O43889 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3O43889 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3O43889 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3O43889 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3O43889 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3O43889 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3O43889 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3O43889 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3O43889 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3O43889 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3O43889 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3O43889 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3O43889 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3O43889 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3O43889 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB3O43889 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3O43889 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3O43889 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3O43889 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3O43889 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3O43889 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3O43889 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3O43889 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CREB3O43889 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3O43889 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3O43889 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3O43889 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3O43889 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3O43889 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3O43889 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3O43889 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3O43889 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3O43889 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3O43889 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3O43889 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3O43889 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3O43889 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3O43889 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3O43889 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3O43889 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3O43889 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3O43889 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3O43889 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3O43889 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3O43889 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3O43889 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3O43889 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3O43889 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3O43889 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3O43889 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3O43889 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3O43889 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3O43889 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3O43889 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3O43889 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3O43889 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3O43889 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3O43889 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3O43889 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3O43889 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3O43889 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3O43889 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3O43889 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3O43889 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3O43889 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3O43889 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3O43889 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3O43889 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3O43889 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3O43889 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3O43889 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3O43889 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3O43889 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms