Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9BO43861 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP9BO43861 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms