Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
HTATSF1O43719 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HTATSF1O43719 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms