Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXA2O43364 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms