Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTIFO43310 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTIFO43310 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTIFO43310 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTIFO43310 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTIFO43310 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTIFO43310 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTIFO43310 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTIFO43310 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTIFO43310 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTIFO43310 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTIFO43310 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTIFO43310 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTIFO43310 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTIFO43310 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTIFO43310 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTIFO43310 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTIFO43310 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTIFO43310 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTIFO43310 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTIFO43310 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTIFO43310 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTIFO43310 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTIFO43310 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTIFO43310 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTIFO43310 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTIFO43310 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTIFO43310 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTIFO43310 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTIFO43310 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTIFO43310 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTIFO43310 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTIFO43310 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTIFO43310 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTIFO43310 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CTIFO43310 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTIFO43310 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTIFO43310 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTIFO43310 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTIFO43310 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTIFO43310 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTIFO43310 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTIFO43310 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTIFO43310 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTIFO43310 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTIFO43310 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTIFO43310 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTIFO43310 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTIFO43310 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTIFO43310 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTIFO43310 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTIFO43310 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTIFO43310 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTIFO43310 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTIFO43310 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTIFO43310 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTIFO43310 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTIFO43310 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTIFO43310 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTIFO43310 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTIFO43310 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTIFO43310 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTIFO43310 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTIFO43310 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTIFO43310 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTIFO43310 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTIFO43310 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTIFO43310 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTIFO43310 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTIFO43310 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTIFO43310 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTIFO43310 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTIFO43310 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTIFO43310 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTIFO43310 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTIFO43310 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTIFO43310 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTIFO43310 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTIFO43310 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTIFO43310 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTIFO43310 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTIFO43310 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CTIFO43310 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTIFO43310 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTIFO43310 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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