Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTLC1O15269 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPTLC1O15269 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms