Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCKDKO14874 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BCKDKO14874 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCKDKO14874 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCKDKO14874 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BCKDKO14874 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCKDKO14874 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BCKDKO14874 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCKDKO14874 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCKDKO14874 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCKDKO14874 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCKDKO14874 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCKDKO14874 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BCKDKO14874 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCKDKO14874 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCKDKO14874 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BCKDKO14874 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BCKDKO14874 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCKDKO14874 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BCKDKO14874 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BCKDKO14874 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCKDKO14874 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BCKDKO14874 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BCKDKO14874 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCKDKO14874 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCKDKO14874 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCKDKO14874 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCKDKO14874 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCKDKO14874 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BCKDKO14874 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BCKDKO14874 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCKDKO14874 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCKDKO14874 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCKDKO14874 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BCKDKO14874 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCKDKO14874 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCKDKO14874 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCKDKO14874 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCKDKO14874 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BCKDKO14874 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms