Protein–RNA interactions for Protein: O14830

PPEF2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF2O14830 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPEF2O14830 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPEF2O14830 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPEF2O14830 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms