Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
POLR3AO14802 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
POLR3AO14802 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms