Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOCS6O14544 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOCS6O14544 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOCS6O14544 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOCS6O14544 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOCS6O14544 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOCS6O14544 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SOCS6O14544 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SOCS6O14544 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOCS6O14544 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOCS6O14544 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SOCS6O14544 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SOCS6O14544 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOCS6O14544 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOCS6O14544 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SOCS6O14544 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOCS6O14544 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOCS6O14544 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOCS6O14544 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOCS6O14544 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS6O14544 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS6O14544 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS6O14544 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS6O14544 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS6O14544 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOCS6O14544 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS6O14544 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS6O14544 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS6O14544 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOCS6O14544 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS6O14544 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS6O14544 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOCS6O14544 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOCS6O14544 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOCS6O14544 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOCS6O14544 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOCS6O14544 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOCS6O14544 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SOCS6O14544 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOCS6O14544 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SOCS6O14544 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms