Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE40O14503 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BHLHE40O14503 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms