Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN5O00501 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN5O00501 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLDN5O00501 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN5O00501 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN5O00501 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN5O00501 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN5O00501 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN5O00501 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN5O00501 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN5O00501 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN5O00501 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN5O00501 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLDN5O00501 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN5O00501 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms