Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GFRA2O00451 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GFRA2O00451 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms