Protein–RNA interactions for Protein: O00212

RHOD, Rho-related GTP-binding protein RhoD, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHODO00212 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHODO00212 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHODO00212 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHODO00212 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHODO00212 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHODO00212 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHODO00212 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHODO00212 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHODO00212 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHODO00212 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHODO00212 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHODO00212 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHODO00212 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHODO00212 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHODO00212 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHODO00212 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHODO00212 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHODO00212 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHODO00212 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHODO00212 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHODO00212 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHODO00212 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHODO00212 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHODO00212 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHODO00212 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHODO00212 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHODO00212 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHODO00212 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHODO00212 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHODO00212 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHODO00212 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHODO00212 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHODO00212 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHODO00212 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHODO00212 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHODO00212 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms