Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms