Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1W4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1W4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1W4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1W4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1W4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1W4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1W4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1W4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1W4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1W4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
H7C1W4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1W4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1W4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1W4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1W4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1W4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1W4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1W4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1W4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
H7C1W4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1W4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1W4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1W4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1W4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1W4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1W4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1W4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1W4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1W4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1W4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1W4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
H7C1W4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
H7C1W4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
H7C1W4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
H7C1W4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
H7C1W4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
H7C1W4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
H7C1W4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
H7C1W4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
H7C1W4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
H7C1W4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
H7C1W4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
H7C1W4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
H7C1W4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
H7C1W4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
H7C1W4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
H7C1W4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
H7C1W4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
H7C1W4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
H7C1W4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
H7C1W4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
H7C1W4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
H7C1W4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H7C1W4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H7C1W4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H7C1W4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
H7C1W4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H7C1W4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
H7C1W4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
H7C1W4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H7C1W4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
H7C1W4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
H7C1W4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
H7C1W4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
H7C1W4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
H7C1W4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
H7C1W4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1W4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1W4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1W4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1W4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1W4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1W4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1W4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1W4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
H7C1W4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
H7C1W4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
H7C1W4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
H7C1W4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
H7C1W4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
H7C1W4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
H7C1W4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
H7C1W4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms