Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQV1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQV1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQV1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQV1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQV1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
H3BQV1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
H3BQV1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQV1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQV1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQV1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQV1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQV1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQV1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQV1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQV1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQV1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQV1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
H3BQV1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H3BQV1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
H3BQV1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
H3BQV1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H3BQV1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H3BQV1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H3BQV1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H3BQV1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
H3BQV1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
H3BQV1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQV1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQV1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
H3BQV1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQV1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQV1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQV1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQV1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQV1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQV1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQV1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQV1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQV1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQV1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQV1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
H3BQV1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQV1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQV1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQV1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQV1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQV1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQV1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQV1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQV1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQV1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
H3BQV1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
H3BQV1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
H3BQV1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
H3BQV1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
H3BQV1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
H3BQV1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H3BQV1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H3BQV1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H3BQV1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H3BQV1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H3BQV1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H3BQV1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
H3BQV1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
H3BQV1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQV1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQV1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQV1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQV1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQV1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQV1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQV1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
H3BQV1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H3BQV1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
H3BQV1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H3BQV1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H3BQV1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
H3BQV1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
H3BQV1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
H3BQV1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H3BQV1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
H3BQV1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
H3BQV1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
H3BQV1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms