Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8VP50 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8VP50 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8VP50 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8VP50 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8VP50 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
F8VP50 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
F8VP50 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
F8VP50 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
F8VP50 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
F8VP50 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
F8VP50 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
F8VP50 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
F8VP50 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
F8VP50 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
F8VP50 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
F8VP50 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F8VP50 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F8VP50 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F8VP50 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F8VP50 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8VP50 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8VP50 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8VP50 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8VP50 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8VP50 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8VP50 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8VP50 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8VP50 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8VP50 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
F8VP50 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8VP50 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8VP50 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8VP50 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8VP50 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8VP50 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8VP50 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8VP50 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8VP50 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8VP50 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8VP50 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8VP50 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8VP50 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
F8VP50 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8VP50 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8VP50 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8VP50 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8VP50 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8VP50 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8VP50 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8VP50 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8VP50 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8VP50 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8VP50 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8VP50 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8VP50 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8VP50 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8VP50 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8VP50 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8VP50 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8VP50 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8VP50 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8VP50 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8VP50 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8VP50 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VP50 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VP50 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VP50 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VP50 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VP50 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VP50 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VP50 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VP50 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VP50 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VP50 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VP50 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VP50 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VP50 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8VP50 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F8VP50 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
F8VP50 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F8VP50 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
F8VP50 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
F8VP50 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F8VP50 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F8VP50 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
F8VP50 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
F8VP50 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
F8VP50 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F8VP50 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
F8VP50 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F8VP50 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F8VP50 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8VP50 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8VP50 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8VP50 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8VP50 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8VP50 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8VP50 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
F8VP50 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms