Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRN3E7EW58 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRN3E7EW58 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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