Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK3BL2E5RIL1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UPK3BL2E5RIL1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms