Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MCRIP1C9JLW8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCRIP1C9JLW8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms