Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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LINC00587B1AMM8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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LINC00587B1AMM8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00587B1AMM8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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LINC00587B1AMM8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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LINC00587B1AMM8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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LINC00587B1AMM8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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LINC00587B1AMM8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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LINC00587B1AMM8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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LINC00587B1AMM8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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LINC00587B1AMM8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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LINC00587B1AMM8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00587B1AMM8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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