Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VGLL3A8MV65 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VGLL3A8MV65 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms